Biopython — вычислительная молекулярная биология

★ 7.0 · research

biopython — это скилл для Claude Code, который предоставляет комплексный набор инструментов вычислительной молекулярной биологии на Python через библиотеку Biopython 1.87. Скилл охватывает манипуляции с последовательностями ДНК, РНК и белков, парсинг форматов FASTA, GenBank, FASTQ, PDB и mmCIF, программный доступ к базам данных NCBI через Bio.Entrez, запуск и разбор результатов BLAST, выравнивание последовательностей, анализ 3D-структур белков и работу с филогенетическими деревьями через Bio.Phylo. Требует Python 3.10+ и NumPy; сетевые операции через Entrez и веб-BLAST нуждаются в переменных окружения NCBI_EMAIL и NCBI_API_KEY, а локальные инструменты BLAST/MUSCLE устанавливаются отдельно. Скилл лучше всего подходит для пакетной обработки, построения кастомных биоинформатических пайплайнов и автоматизации BLAST — биологам и биоинформатикам, работающим с геномными данными и структурной биоинформатикой.