Datamol — хемоинформатика и молекулярный анализ

★ 7.0 · data

datamol — это скилл для Claude Code, который предоставляет Pythonic-обёртку над RDKit с упрощённым интерфейсом и разумными настройками по умолчанию для задач хемоинформатики и открытия лекарств. Скилл охватывает десять рабочих областей: разбор и стандартизацию SMILES, вычисление дескрипторов и отпечатков (ECFP4, MACCS, атомные пары), кластеризацию молекул, генерацию 3D-конформеров, анализ скаффолдов по Bemis–Murcko, фрагментацию (BRICS/RECAP), визуализацию и применение химических реакций. Все объекты возвращаются как нативные `rdkit.Chem.Mol`, а пакетные операции поддерживают параллельную обработку через параметр `n_jobs`. Облачное чтение файлов (S3, GCS) доступно через fsspec; для продвинутого контроля рекомендуется обращаться к RDKit напрямую.