DepMap — анализ зависимостей раковых клеток от генов

★ 7.0 · research

depmap — это скилл для Claude Code, который позволяет запрашивать Cancer Dependency Map (DepMap) Broad Institute для анализа зависимостей раковых клеточных линий от генов, CRISPR Chronos-скоров, данных чувствительности к лекарственным соединениям и профилей генного эффекта. Скилл поддерживает работу через DepMap API и локальный анализ загруженных файлов (CRISPRGeneEffect.csv, sample_info.csv и других), включая фильтрацию по порогам Chronos (≤ −0.5 — вероятная зависимость, ≤ −1 — сильная), поиск синтетических летальных взаимодействий и корреляционный анализ ко-эссенциальных пар генов. Подходит онкологам, биоинформатикам и исследователям, валидирующим терапевтические мишени, изучающим рак-специфические уязвимости или предсказывающим биомаркеры ответа на нокаут гена.