FlowIO — работа с файлами проточной цитометрии
★ 7.0 · data
flowio — это скилл для Claude Code, который читает, инспектирует и записывает файлы Flow Cytometry Standard (FCS) версий 2.0, 3.0 и 3.1 с помощью библиотеки FlowIO 1.4.0. Скилл охватывает низкоуровневую работу с FCS: извлечение метаданных из секций HEADER, TEXT и ANALYSIS, получение данных событий в виде двумерного массива NumPy через `as_array()` с опциональным применением gain/log/time-масштабирования, чтение legacy-файлов с несколькими датасетами и запись FCS 3.1 list-mode single-precision через `create_fcs()`. Парсинг выполняется локально без сетевого доступа; pandas опционален для DataFrame-workflows. Подходит биоинформатикам и исследователям проточной цитометрии, которым нужно подготовить сырые FCS-данные для машинного обучения или downstream-анализа — компенсация, logicle-трансформации и гейтинг в скилл не входят и требуют FlowKit.
- #flow-cytometry
- #fcs-files
- #data-parsing
- #bioinformatics
- #preprocessing