Geniml — ML-анализ геномных интервалов в формате BED

★ 7.0 · ai-tooling

geniml — это скилл для Claude Code, который автоматизирует машинное обучение и статистические рабочие процессы над геномными интервальными наборами в формате BED. Скилл валидирует BED-файлы и контракты universe, планирует запуски Region2Vec и scEmbed, проверяет совместимость моделей и токенизаторов, а также оценивает консенсусные universes — всё локально, без сетевых запросов. Внутри используются geniml 0.8.4 и gtars 0.9.2 (Python 3.10+), встроенные скрипты-валидаторы и планировщики не импортируют Geniml напрямую и не запускают субпроцессы. Подходит биоинформатикам, работающим с данными scATAC-seq, эмбеддингами геномных регионов и анализом доступности хроматина: инструмент явно разграничивает координатные соглашения, сборки генома и чувствительные метаданные образцов.