gget — биоинформатический анализ генов и белков

★ 7.0 · data

gget — это скилл для Claude Code, который обеспечивает единый доступ к 20+ биоинформатическим базам данных через CLI и Python. Включает 23 модуля шести категорий: поиск и аннотация генов (search, info, seq), выравнивание последовательностей (blast, blat, muscle, diamond), анализ структур белков (alphafold, pdb, elm), данные экспрессии и заболеваний (archs4, cellxgene, enrichr, opentargets, cosmic, cbio), вирусные последовательности и мышиная специфичность (virus, 8cube). Скилл нацелен на версию gget 0.30.5 (Python ≥ 3.8) и охватывает типичные задачи: интерактивный поиск информации о генах, анализ обогащения, загрузку структур AlphaFold, запросы к COSMIC и CELLxGENE. Для пакетной обработки BLAST рекомендуется biopython, для многобазовых Python-пайплайнов — bioservices.