gtars — анализ геномных интервалов для биоинформатики
★ 7.0 · data
gtars — это скилл для Claude Code, который обеспечивает работу с геномными интервалами через нативные реализации на Rust, Python-привязки (gtars==0.9.2, Python 3.10+) и CLI-бинарник gtars-cli==0.9.0. Скилл поддерживает обнаружение перекрытий регионов, подсчёт покрытия, алгебру множеств интервалов, консенсус и редукцию, токенизацию геномных регионов для ML-моделей, обработку фрагментов одиночных клеток, а также работу с BED-файлами и refget. Инструмент соблюдает строгий контракт данных: координаты BED в формате 0-based half-open, тип u32, верификация сборки по SHA-256 хромосомных размеров. Подходит биоинформатикам и исследователям, решающим задачи анализа геномных интервалов, вычислительной геномики и подготовки данных для эпигеномных ML-моделей.
- #genomics
- #bioinformatics
- #interval-analysis
- #bed-files
- #machine-learning
- #fragment-analysis
- #rust-python