RDKit — хемоинформатика и анализ молекул

★ 7.5 · general

rdkit — это скилл для Claude Code, который подключает Python-библиотеку RDKit для работы с молекулярными структурами: генерации 3D-конформеров, обработки SMILES/InChI, вычисления дескрипторов и поиска подструктур. Скилл включает готовые скрипты для генерации до 50 конформеров методом ETKDGv3 с оптимизацией геометрии через MMFF94/UFF и экспортом в SDF и XYZ, расчёта дескрипторов (MW, LogP, TPSA, HBD, HBA, RotBonds), вычисления отпечатков Morgan/ECFP4 (2048 бит) и коэффициента сходства Танимото, а также канонизации SMILES. Требует установленного пакета RDKit (conda-forge или pip). Подходит для задач хемоинформатики, подготовки молекул к докингу и расчёту молекулярного сходства.