ReacNetGenerator — анализ химических реакций из MD-траекторий

★ 7.5 · general

reacnetgen — это скилл для Claude Code, который извлекает и визуализирует сети химических реакций из реактивных MD-траекторий с помощью ReacNetGenerator. Принимает LAMMPS dump с файлом связей ReaxFF (`bonds.reax`) или XYZ-траектории, запускает анализ через CLI или Python API и выдаёт SVG/HTML-граф реакций, таблицу видов с SMILES и счётчиками, матрицу частот реакций и PNG-графики концентраций во времени. Ключевые параметры — интервал кадров (`--stepinterval`), число чанков (`--split`), порог порядка связи (`--cutoff`) и число параллельных воркеров (`--nproc`). Скилл встраивается в пайплайн после ReaxFF или AIMD расчётов и применяется в задачах изучения горения, пиролиза и других реактивных процессов — там, где нужно автоматически идентифицировать интермедиаты и маршруты превращений.