histolab — обработка патологических слайдов WSI

★ 7.0 · media-processing

histolab — это скилл для Claude Code, который автоматизирует обработку цифровых патологических слайдов (WSI) на Python: обнаружение ткани, извлечение тайлов из гигапиксельных изображений и подготовку датасетов для глубокого обучения. Библиотека поддерживает три стратегии тайлинга — RandomTiler, GridTiler и ScoreTiler — а также нормализацию окрашивания H&E методами Reinhard и Macenko. Внутри задокументированы шесть областей: управление слайдами, тканевые маски (TissueMask, BiggestTissueBoxMask), фильтры и морфологическая предобработка, визуализация и пять сквозных рабочих процессов. Совместим с Python 3.8–3.11 на Linux и macOS; требует системных библиотек OpenSlide; для встроенных TCGA-слайдов нужен pooch. Подходит для построения простых пайплайнов цифровой патологии, курирования датасетов и задач гистопатологического анализа без сложной мультиплексной визуализации.