AlphaFold — анализ структуры белка и поиск карманов

data

alphafold_structure_pipeline автоматизирует в Claude Code полный цикл анализа AlphaFold-структур белков: загружает предсказанную структуру по UniProt ID, предсказывает связывающие карманы через fpocket, извлекает аминокислотную последовательность из PDB-файла и вычисляет базовую статистику структуры. Скилл объединяет 4 инструмента с 3 MCP-серверов: download_alphafold_structure и calculate_pdb_basic_info из DrugSDA-Tool, run_fpocket из DrugSDA-Model и extract_pdb_sequence из VenusFactory. Подходит для задач вычислительной биологии и структурной биоинформатики — в частности, когда нужно быстро найти активные центры белка или подготовить данные для докинга.